Um dos desafios tecnológicos enfrentados pela engenharia deste projeto foram as soluções técnicas proporcionadas na otimização do aproveitamento térmico. Por um lado, aproveita-se o calor libertado pelos gases de escape e as camisas de refrigeração dos motores de cogeração num processo de pasteurização com recuperação de calor integrado. Por outro, também se destina a um processo de tratamento do digerido líquido que permite que parte do mesmo seja vertido em curso de água, pois, pelas magnitudes da instalação, a quantidade do digerido líquido resultante é superior às necessidades das instalações agrárias dos arredores. De facto, era impossível utilizar outras tecnologias de depuração devido à falta de espaço, mas o uso deste calor “recuperado” noutros processos da instalação permite otimizar o diagrama de massas e energias gerando, para além disso, uma poupança notável nos custos de operação da instalação.